Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ID3Q02535 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ID3Q02535 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ID3Q02535 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ID3Q02535 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ID3Q02535 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ID3Q02535 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ID3Q02535 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ID3Q02535 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ID3Q02535 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ID3Q02535 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ID3Q02535 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ID3Q02535 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ID3Q02535 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ID3Q02535 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ID3Q02535 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ID3Q02535 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ID3Q02535 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ID3Q02535 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ID3Q02535 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ID3Q02535 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ID3Q02535 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ID3Q02535 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ID3Q02535 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ID3Q02535 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ID3Q02535 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ID3Q02535 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ID3Q02535 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ID3Q02535 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ID3Q02535 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ID3Q02535 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ID3Q02535 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ID3Q02535 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms