Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDR2Q01850 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDR2Q01850 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms