Protein–RNA interactions for Protein: Q01581

HMGCS1, Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCS1Q01581 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGCS1Q01581 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMGCS1Q01581 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms