Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCN7AQ01118 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCN7AQ01118 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCN7AQ01118 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCN7AQ01118 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms