Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MYBPC1Q00872 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms