Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NDPQ00604 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDPQ00604 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDPQ00604 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDPQ00604 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDPQ00604 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDPQ00604 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDPQ00604 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDPQ00604 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NDPQ00604 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDPQ00604 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDPQ00604 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDPQ00604 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDPQ00604 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDPQ00604 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDPQ00604 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDPQ00604 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDPQ00604 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDPQ00604 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NDPQ00604 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NDPQ00604 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDPQ00604 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDPQ00604 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDPQ00604 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDPQ00604 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NDPQ00604 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDPQ00604 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDPQ00604 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NDPQ00604 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NDPQ00604 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDPQ00604 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDPQ00604 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDPQ00604 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDPQ00604 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDPQ00604 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDPQ00604 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDPQ00604 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NDPQ00604 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NDPQ00604 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDPQ00604 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDPQ00604 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDPQ00604 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NDPQ00604 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDPQ00604 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDPQ00604 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDPQ00604 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NDPQ00604 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDPQ00604 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NDPQ00604 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms