Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDLBPQ00341 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HDLBPQ00341 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HDLBPQ00341 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HDLBPQ00341 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HDLBPQ00341 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDLBPQ00341 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDLBPQ00341 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HDLBPQ00341 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HDLBPQ00341 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDLBPQ00341 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDLBPQ00341 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDLBPQ00341 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDLBPQ00341 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HDLBPQ00341 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDLBPQ00341 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDLBPQ00341 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDLBPQ00341 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HDLBPQ00341 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HDLBPQ00341 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDLBPQ00341 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDLBPQ00341 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HDLBPQ00341 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDLBPQ00341 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDLBPQ00341 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDLBPQ00341 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms