Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX1P83916 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX1P83916 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX1P83916 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX1P83916 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBX1P83916 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX1P83916 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX1P83916 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX1P83916 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX1P83916 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX1P83916 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX1P83916 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX1P83916 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CBX1P83916 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX1P83916 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX1P83916 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX1P83916 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX1P83916 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX1P83916 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX1P83916 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBX1P83916 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX1P83916 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX1P83916 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX1P83916 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX1P83916 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX1P83916 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX1P83916 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBX1P83916 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX1P83916 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX1P83916 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX1P83916 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX1P83916 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX1P83916 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX1P83916 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBX1P83916 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX1P83916 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBX1P83916 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX1P83916 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX1P83916 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX1P83916 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX1P83916 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBX1P83916 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBX1P83916 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBX1P83916 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX1P83916 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX1P83916 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX1P83916 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBX1P83916 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX1P83916 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX1P83916 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX1P83916 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX1P83916 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX1P83916 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX1P83916 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX1P83916 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX1P83916 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX1P83916 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBX1P83916 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX1P83916 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX1P83916 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX1P83916 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX1P83916 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX1P83916 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX1P83916 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX1P83916 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX1P83916 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBX1P83916 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX1P83916 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX1P83916 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX1P83916 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX1P83916 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX1P83916 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBX1P83916 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms