Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2IP63279 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2IP63279 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBE2IP63279 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms