Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL38P63173 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL38P63173 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL38P63173 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL38P63173 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL38P63173 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL38P63173 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL38P63173 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL38P63173 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL38P63173 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL38P63173 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL38P63173 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL38P63173 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL38P63173 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL38P63173 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL38P63173 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL38P63173 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL38P63173 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL38P63173 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL38P63173 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL38P63173 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL38P63173 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL38P63173 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL38P63173 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL38P63173 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL38P63173 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL38P63173 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL38P63173 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL38P63173 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL38P63173 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL38P63173 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL38P63173 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL38P63173 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms