Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P63121 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113P63121 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms