Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL39P62891 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P62891 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P62891 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P62891 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P62891 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P62891 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P62891 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P62891 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P62891 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P62891 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P62891 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P62891 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P62891 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P62891 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P62891 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P62891 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P62891 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P62891 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P62891 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P62891 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P62891 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P62891 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P62891 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P62891 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P62891 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P62891 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P62891 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P62891 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P62891 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL39P62891 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL39P62891 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P62891 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P62891 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P62891 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P62891 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P62891 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P62891 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P62891 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P62891 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL39P62891 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL39P62891 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms