Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2LP62875 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2LP62875 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2LP62875 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms