Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSMC1P62191 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSMC1P62191 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSMC1P62191 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms