Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S1P61966 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP1S1P61966 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S1P61966 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms