Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CTXN1P60606 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTXN1P60606 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms