Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCCD1P59942 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MCCD1P59942 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms