Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EEFSECP57772 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EEFSECP57772 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms