Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSDMDP57764 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms