Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BRPF1P55201 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRPF1P55201 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRPF1P55201 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms