Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD23BP54727 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23BP54727 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD23BP54727 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms