Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK1P53667 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms