Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPAP53621 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPAP53621 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPAP53621 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPAP53621 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPAP53621 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPAP53621 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPAP53621 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPAP53621 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPAP53621 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPAP53621 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPAP53621 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPAP53621 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPAP53621 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPAP53621 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPAP53621 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPAP53621 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPAP53621 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPAP53621 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COPAP53621 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COPAP53621 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPAP53621 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPAP53621 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPAP53621 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPAP53621 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COPAP53621 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPAP53621 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPAP53621 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COPAP53621 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COPAP53621 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COPAP53621 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COPAP53621 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPAP53621 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COPAP53621 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COPAP53621 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms