Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GBX2P52951 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GBX2P52951 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GBX2P52951 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBX2P52951 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBX2P52951 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBX2P52951 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GBX2P52951 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GBX2P52951 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX2P52951 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX2P52951 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX2P52951 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX2P52951 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX2P52951 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX2P52951 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX2P52951 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GBX2P52951 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBX2P52951 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBX2P52951 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX2P52951 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBX2P52951 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms