Protein–RNA interactions for Protein: P52943

CRIP2, Cysteine-rich protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2P52943 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRIP2P52943 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRIP2P52943 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms