Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF135P52742 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF135P52742 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms