Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2A1P52655 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2A1P52655 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1P52655 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms