Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLCN6P51797 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN6P51797 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLCN6P51797 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms