Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC41.63■■■■■ 4.26
SMARCA2P51531 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
SMARCA2P51531 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SMARCA2P51531 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SMARCA2P51531 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms