Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB28P51157 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB28P51157 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB28P51157 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB28P51157 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB28P51157 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB28P51157 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB28P51157 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB28P51157 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB28P51157 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB28P51157 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB28P51157 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB28P51157 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB28P51157 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB28P51157 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB28P51157 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB28P51157 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB28P51157 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB28P51157 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB28P51157 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB28P51157 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB28P51157 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB28P51157 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB28P51157 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB28P51157 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB28P51157 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB28P51157 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB28P51157 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB28P51157 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB28P51157 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB28P51157 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB28P51157 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB28P51157 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB28P51157 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB28P51157 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB28P51157 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB28P51157 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB28P51157 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB28P51157 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB28P51157 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB28P51157 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB28P51157 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB28P51157 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB28P51157 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB28P51157 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB28P51157 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB28P51157 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB28P51157 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB28P51157 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB28P51157 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB28P51157 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB28P51157 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB28P51157 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB28P51157 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB28P51157 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB28P51157 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB28P51157 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB28P51157 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB28P51157 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB28P51157 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB28P51157 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB28P51157 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB28P51157 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB28P51157 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms