Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB5CP51148 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RAB5CP51148 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms