Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBP50607 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBP50607 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBP50607 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBP50607 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBP50607 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBP50607 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBP50607 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBP50607 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBP50607 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBP50607 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBP50607 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBP50607 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBP50607 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBP50607 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBP50607 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBP50607 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBP50607 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBP50607 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBP50607 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBP50607 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBP50607 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBP50607 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBP50607 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBP50607 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBP50607 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBP50607 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBP50607 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBP50607 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBP50607 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBP50607 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBP50607 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBP50607 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBP50607 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBP50607 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBP50607 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBP50607 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBP50607 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBP50607 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBP50607 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBP50607 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBP50607 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBP50607 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBP50607 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBP50607 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBP50607 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBP50607 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBP50607 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBP50607 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBP50607 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBP50607 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBP50607 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBP50607 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBP50607 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBP50607 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBP50607 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBP50607 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBP50607 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBP50607 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBP50607 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBP50607 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBP50607 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBP50607 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBP50607 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBP50607 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBP50607 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TUBP50607 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBP50607 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBP50607 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBP50607 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBP50607 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBP50607 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBP50607 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBP50607 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBP50607 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBP50607 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBP50607 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBP50607 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBP50607 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBP50607 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBP50607 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBP50607 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBP50607 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBP50607 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBP50607 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBP50607 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBP50607 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBP50607 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBP50607 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBP50607 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBP50607 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBP50607 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBP50607 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBP50607 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBP50607 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBP50607 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBP50607 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBP50607 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBP50607 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBP50607 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms