Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARRES1P49788 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARRES1P49788 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARRES1P49788 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms