Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN1P49768 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSEN1P49768 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN1P49768 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms