Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPINT3P49223 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPINT3P49223 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms