Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TGM4P49221 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM4P49221 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM4P49221 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM4P49221 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM4P49221 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM4P49221 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM4P49221 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM4P49221 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM4P49221 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM4P49221 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TGM4P49221 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TGM4P49221 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TGM4P49221 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TGM4P49221 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM4P49221 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM4P49221 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM4P49221 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TGM4P49221 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TGM4P49221 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM4P49221 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM4P49221 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM4P49221 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM4P49221 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM4P49221 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM4P49221 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM4P49221 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM4P49221 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TGM4P49221 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM4P49221 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM4P49221 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM4P49221 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM4P49221 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM4P49221 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM4P49221 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM4P49221 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM4P49221 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM4P49221 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TGM4P49221 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TGM4P49221 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TGM4P49221 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM4P49221 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM4P49221 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM4P49221 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM4P49221 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TGM4P49221 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms