Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMTP48728 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMTP48728 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMTP48728 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMTP48728 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMTP48728 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMTP48728 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMTP48728 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMTP48728 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMTP48728 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMTP48728 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMTP48728 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMTP48728 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMTP48728 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMTP48728 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMTP48728 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMTP48728 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMTP48728 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMTP48728 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMTP48728 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMTP48728 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMTP48728 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMTP48728 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AMTP48728 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AMTP48728 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AMTP48728 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMTP48728 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMTP48728 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMTP48728 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMTP48728 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMTP48728 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMTP48728 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMTP48728 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMTP48728 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AMTP48728 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMTP48728 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMTP48728 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AMTP48728 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms