Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRIP1P48552 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NRIP1P48552 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms