Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRA4P48169 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRA4P48169 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRA4P48169 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms