Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA8P48165 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA8P48165 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA8P48165 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA8P48165 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJA8P48165 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA8P48165 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA8P48165 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA8P48165 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA8P48165 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA8P48165 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA8P48165 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJA8P48165 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA8P48165 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA8P48165 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA8P48165 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA8P48165 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA8P48165 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA8P48165 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GJA8P48165 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA8P48165 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA8P48165 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA8P48165 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA8P48165 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA8P48165 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA8P48165 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA8P48165 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJA8P48165 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA8P48165 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA8P48165 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA8P48165 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA8P48165 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA8P48165 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA8P48165 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJA8P48165 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA8P48165 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA8P48165 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA8P48165 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA8P48165 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA8P48165 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA8P48165 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA8P48165 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA8P48165 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA8P48165 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA8P48165 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA8P48165 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA8P48165 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA8P48165 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA8P48165 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA8P48165 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA8P48165 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA8P48165 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA8P48165 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA8P48165 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GJA8P48165 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
GJA8P48165 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA8P48165 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA8P48165 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA8P48165 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA8P48165 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA8P48165 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA8P48165 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA8P48165 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA8P48165 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA8P48165 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA8P48165 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA8P48165 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA8P48165 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA8P48165 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA8P48165 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA8P48165 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA8P48165 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA8P48165 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA8P48165 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA8P48165 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA8P48165 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA8P48165 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA8P48165 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA8P48165 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA8P48165 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA8P48165 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA8P48165 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA8P48165 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA8P48165 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA8P48165 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA8P48165 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA8P48165 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA8P48165 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA8P48165 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJA8P48165 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms