Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME1P48163 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME1P48163 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME1P48163 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME1P48163 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME1P48163 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME1P48163 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME1P48163 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ME1P48163 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME1P48163 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME1P48163 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME1P48163 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME1P48163 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME1P48163 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME1P48163 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME1P48163 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME1P48163 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME1P48163 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ME1P48163 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME1P48163 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME1P48163 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME1P48163 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME1P48163 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME1P48163 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME1P48163 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ME1P48163 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME1P48163 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME1P48163 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME1P48163 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME1P48163 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME1P48163 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME1P48163 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME1P48163 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME1P48163 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME1P48163 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME1P48163 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME1P48163 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME1P48163 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME1P48163 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME1P48163 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME1P48163 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME1P48163 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME1P48163 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME1P48163 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ME1P48163 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ME1P48163 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME1P48163 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME1P48163 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME1P48163 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME1P48163 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME1P48163 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ME1P48163 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME1P48163 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME1P48163 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME1P48163 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME1P48163 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME1P48163 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME1P48163 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME1P48163 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME1P48163 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ME1P48163 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME1P48163 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME1P48163 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME1P48163 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME1P48163 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME1P48163 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME1P48163 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME1P48163 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME1P48163 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME1P48163 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME1P48163 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ME1P48163 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME1P48163 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME1P48163 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME1P48163 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME1P48163 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME1P48163 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME1P48163 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms