Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC6A11P48066 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC6A11P48066 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms