Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIA4P48058 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA4P48058 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms