Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALDH1A3P47895 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALDH1A3P47895 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A3P47895 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms