Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABRB2P47870 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB2P47870 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms