Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BRCC3P46736 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCC3P46736 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms