Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MAP2K4P45985 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MAP2K4P45985 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MAP2K4P45985 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MAP2K4P45985 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MAP2K4P45985 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms