Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSKP43235 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSKP43235 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSKP43235 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSKP43235 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSKP43235 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSKP43235 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSKP43235 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSKP43235 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSKP43235 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSKP43235 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSKP43235 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSKP43235 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSKP43235 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSKP43235 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSKP43235 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSKP43235 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSKP43235 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSKP43235 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSKP43235 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSKP43235 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSKP43235 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSKP43235 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSKP43235 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSKP43235 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSKP43235 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSKP43235 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSKP43235 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSKP43235 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSKP43235 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSKP43235 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSKP43235 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSKP43235 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSKP43235 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSKP43235 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSKP43235 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSKP43235 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSKP43235 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSKP43235 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSKP43235 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSKP43235 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSKP43235 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSKP43235 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSKP43235 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSKP43235 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSKP43235 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSKP43235 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSKP43235 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSKP43235 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSKP43235 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSKP43235 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSKP43235 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSKP43235 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSKP43235 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSKP43235 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSKP43235 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSKP43235 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSKP43235 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSKP43235 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSKP43235 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSKP43235 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSKP43235 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSKP43235 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSKP43235 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSKP43235 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSKP43235 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSKP43235 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSKP43235 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSKP43235 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSKP43235 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSKP43235 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSKP43235 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSKP43235 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms