Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PI4KAP42356 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PI4KAP42356 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PI4KAP42356 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms