Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMPOP42166 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMPOP42166 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TMPOP42166 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMPOP42166 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
TMPOP42166 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMPOP42166 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMPOP42166 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMPOP42166 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMPOP42166 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TMPOP42166 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMPOP42166 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMPOP42166 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMPOP42166 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TMPOP42166 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMPOP42166 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMPOP42166 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMPOP42166 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMPOP42166 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMPOP42166 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TMPOP42166 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TMPOP42166 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
TMPOP42166 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
TMPOP42166 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMPOP42166 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMPOP42166 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMPOP42166 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMPOP42166 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMPOP42166 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMPOP42166 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMPOP42166 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMPOP42166 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMPOP42166 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMPOP42166 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMPOP42166 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMPOP42166 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMPOP42166 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMPOP42166 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMPOP42166 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TMPOP42166 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMPOP42166 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMPOP42166 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMPOP42166 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMPOP42166 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMPOP42166 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMPOP42166 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMPOP42166 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMPOP42166 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMPOP42166 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMPOP42166 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TMPOP42166 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMPOP42166 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMPOP42166 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMPOP42166 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMPOP42166 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMPOP42166 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMPOP42166 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMPOP42166 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TMPOP42166 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMPOP42166 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMPOP42166 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMPOP42166 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMPOP42166 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TMPOP42166 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TMPOP42166 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMPOP42166 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMPOP42166 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMPOP42166 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMPOP42166 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMPOP42166 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMPOP42166 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMPOP42166 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMPOP42166 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMPOP42166 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMPOP42166 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMPOP42166 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMPOP42166 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMPOP42166 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMPOP42166 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMPOP42166 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMPOP42166 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMPOP42166 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMPOP42166 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMPOP42166 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TMPOP42166 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMPOP42166 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMPOP42166 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMPOP42166 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMPOP42166 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMPOP42166 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMPOP42166 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMPOP42166 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMPOP42166 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMPOP42166 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMPOP42166 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMPOP42166 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMPOP42166 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMPOP42166 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMPOP42166 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TMPOP42166 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms